제목

Lactobacillus allii sp. nov. isolated from scallion kimchi

(신종미생물 락토바실러스 알리 WiKim39(Lactobacillus allii WiKim39) 발견)

요약

본 연구는 2013년부터 전국의 가정집 및 명가의 김치를 수집하고 이로부터 3만 여종의 미생물자원을 확보하여 유전체 분석을 수행하였다. 쪽파김치에서 락토바실러스(Lactobacillus)속의 신종 유산균을 분리하였으며, 이의 분류학적 특성분석을 진행하였다.

이 신종 유산균 락토바실러스 알리 WiKim39(Lactobacillus allii WiKim39)는  0.6×1.8-2.5 μm의 크기로 그람 양성, 비포자성 간균, 카탈라아제 음성, 비운동성의 특성을 갖는 미생물로 나타났으며 동형발효(homofermentative)를 거치면서 세포는 D- 및 L-젖산(lactic acid)을 52:48의 비율로 생산하는 것으로 확인되었다.

신종 유산균의 게놈 DNA 분석결과, G+C 함량은 35.3 mol %이고 크기는 2.53 Mb으로 확인되었다.

16S rRNA를 이용한 계통학적 분류 분석결과, Lactobacillus nodensis, Lactobacillus insicii, Lactobacillus versmoldensis, Lactobacillus tucceti and Lactobacillus furfuricola와 97.1~98.2%의 상동성을 나타내어 WiKim39균주는 락토바실러스 속에 해당되는 것을 확인하였다.

이들 근연의 유산균들과 게놈서열의 유사성을 비교하기 위해 이들 표준균주들과 뉴클레오티드 동일성(ANI: Average Nucleotide Identity values)을 비교한 결과, 78.6%의 ANI value를 나타내었다. 표현형(phenotypic), 생화학적(biochemical), 계통학적 분석을 종합하여 Wikim39는 락토바실러스 속의 신종유산균임을 확인하였다.