제목
Genomic Analysis of Pathogenic Bacterium, Paeniclostridium sordellii CBA7122 Containing the Highest Number of rRNA Operons, Isolated from a Human Stool Sample

(인체 분변에서 분리된 가장 많은 수의 rRNA 오페론을 함유한 Paeniclostridium sordellii CBA7122 세균의 유전체 분석)

요약

Paeniclostridium sordellii는 대부분 비병원성이지만, 일부 균주는 인간과 동물에게 급성 감염을 일으키는 것으로 알려져 있다. Paeniclostridium sordellii의 심각한 감염성에도 불구하고, 첫 증상을 인지한 시점에서 죽음까지 매우 짧기 때문에 치료가 어려운 것으로 알려져 있다.

본 연구는 한국인 분변 시료에서 분리한 Paeniclostridium sordellii CBA7122의 유전체를 해독하고 비교유전체 분석을 수행한 내용이다. CBA7122의 유전체를 분석한 결과, 3,550,411 bp의 길이였으며, 3,459개의 유전자가 발견되었다. 프로파지 분석을 통해 한 개의 완전한 프로파지와 두개의 불완전한 프로파지를 찾아냈다.

CBA7122는 지금까지 알려진 것 보다 많은 총 17개의 rRNA 오페론을 가지고 있었다. 이전 연구결과에 따르면 rRNA 오페론의 수는 균의 성장률과 성장 효율, 두 요소와 관련이 있는 것으로 알려져 있다. 비교유전체 분석을 통하여 VPI 9048, ATCC 9714T 균주와 각각 98.69%, 98.31%의 상동성을 가지고 있는 것으로 확인되었으며, 이들과 CBA7122 간의 코어 게놈은 2,481개의 유전자를 포함하고 있었고, CBA7122 특이적 유전자는 145개이었다. CBA7122는 다양한 독성인자를 가지고 있었으나, 사망으로 이어지는 인감 감염의 주요 인자로 알려진 클로스트리디움 세포독소 유전자는 없었다.

유전체 분석에 기초한 이번 연구는 유전체에 존재하는 독성 인자와 인간의 건강에 미치는 영향을 이해하기 위한 연구에 참고자료가 될 수 있을 것이다.