제목

Complete genome sequence of a commensal bacterium, Hafnia alvei CBA7124, isolated from human feces

(한국인 분변 시료에서 분리한 Hafnia alvei  CBA7124 균주의 전장유전체 분석)

요약

본 연구는 한국인 분변시료에서 분리한 Hafnia alvei CBA7124 균주의 전장유전체 서열과 비교유전체 분석을 수행하였다.

Hafnia alvei는 혐기성 그람 음성균으로 장내 및 장외 감염을 일으키는 기회 감염균으로 알려져 있다. Pacific Biosciences RS II 장비를 사용하여 유전체 분석한 결과 총 길이는 4,585,298 bp 이고, 25개의 rRNA, 88개의 tRNA, 4,043개의 단백질 코딩 유전자들이 확인되었다.

기능적 특성을 확인한 결과 이 유전체에는 독소-항독소 시스템과 항생제 저항에 관련된 유전자들이 분석되었다.

또한, 다른 Hafnia alvei 종과 비교 유전체 분석을 통해 Hafnia alvei CBA7124만 가지고 있는 72개의 유전자도 확인되었다.

유전자 분석을 통해 제시된 데이터들은 Hafnia alvei의 발병 기전과 작용 기작을 이해하는데 새로운 통찰력 제공 및 추가 연구를 위한 기반을 마련했다.