제목

Complete genome sequence of Lactobacillus curvatus strain WiKim38 isolated from kimchi

(김치에서 분리한 락토바실러스 커바투스 WiKim38 유전체의 완전한 서열)

요약

Lactobacillus curvatus WiKim38는 잠재적인 프로바이오틱 균주로서, 김치에서 분리되었다. 이 균주 DNA의 완전한 서열의 길이는 1,940,170bp이며, G+C함량은 약 41.93%이다. 이 균주는 하나의 크로모좀에 1,885개의 코딩 DNA 서열, 74개의 pseudogene, 6개의 rRNA 오페론, 그리고 65개의 tRNA 유전자를 가지고 있다.

COG(Clusters of Orthologous Groups) 분석 결과, L그룹에 해당되는 190개의 복제(replication), 재조합(recombination), 복구(repair) 유전자를 가장 많이 가지고 있음을 확인할 수 있었다. 미생물이 잠재적인 프로바이오틱스 특성을 갖는 다양한 기준 중 하나는 장 표면에 부착하는 특징과 이로 인해 미생물의 장내 생존율이 증가한다는 것이다.

WiKim38 균주의 유전체 분석 결과, 몇 가지 장 부착 특성을 갖는 유전자서열을 발견할 수 있었다. dltABCD 유전자로 인코딩된 D-alanyl-lipoteichoic acid와 epsHCDE 유전자로 인코딩된 EPS(Extracellular polymeric substances) 그리고 sortase A와 같은 세포 표면 단백질, LPxTG motif와 같은 세포-벽-고정 단백질(cell-wall-anchored proteins)의 유전자 역시 유전체 분석을 통해 확인할 수 있었다.

이러한 결과들은 장내 상피세포에 대한 L. curvatus WiKim38의 부착 능력과 장내환경에서의 생존 전략을 설명한다.